Bactériologie

Bactériologie

Le laboratoire de Bactériologie analyse les prélèvements effectués chez les patients hospitalisés ou consultants au CHU Caen Normandie, à la recherche de bactéries pathogènes.

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Équipe

Composition du service

2 professeurs des universités · praticiens hospitaliers

1 maître de conférences des universités · praticien hospitalier

3 praticiens hospitaliers

1 assistant hospitalo-universitaire

1 cadre de santé

1 cadre supérieure de santé

Département des agents infectieux

Détail de l’équipe

Professeur des Universités · Praticien Hospitalier

Pr Simon Le Hello

Responsable du Laboratoire de Biologie et de l’ITBS

Professeur des Universités · Praticien Hospitalier

Pr Olivier Join-Lambert

Biologiste

Maître de Conférences des Universités · Praticien Hospitalier

Dr Christophe Isnard

Biologiste

Praticien Hospitalier

Dr Marguerite Fines-Guyon

Biologiste

Praticien Hospitalier

Dr Claire Daurel

Biologiste

Praticien Hospitalier

Dr Damasie Malandain

Biologiste

Assistant hospitalier universitaire

Dr Francois Gravey

Biologiste

Cadre de santé

Manuela Leroux
Pr Simon Le Hello

Chef de service

Florence Agourd

Cadre supérieure de santé
Nos prises en charge

Activités

Activités diagnostiques

Le secteur de Microbiologie regroupe les activités diagnostiques en Bactériologie, Mycologie et Parasitologie sur le site Côte de Nacre. Il est organisé en 7 sous-secteurs :

PCR syndromiques

Culture bactérienne

Identification et antibiogramme

Mycobactéries (laboratoire P3)

Sérologies bactériennes, fongiques et parasitaires

Biologie moléculaire

Épidémiologie génomique

Diagnostic bactériologique et conseil thérapeutique

Réalisation d’analyses bactériologiques : examens directs, cultures, identifications par spectrométrie de masse de type MALDI-TOF, méthodes antigéniques, sérologiques et moléculaires (PCR spécifiques, « pan » bactériennes)

Diagnostic classique et rapide (par biologie moléculaire) de la tuberculose ; diagnostic des infections à mycobactéries atypiques, antibiogrammes des mycobactéries

détermination de la sensibilité aux antibiotiques (antibiogramme), incluant la méthode de référence par micro-dilution en milieu liquide (Détermination des Concentration Minimales Inhibitrices) (Système VIZION)

rôle d’alerte et de conseil thérapeutique en cas de diagnostic d’infections sévères (bactériémie, endocardite…).

Prévention du risque infectieux :

Identification des bactéries multi-résistantes (BMR) et Hautement Résistantes émergentes (BHRe).

Service Prévention et contrôle des infections

Missions hospitalières

Diagnostic des infections bactériennes 24h/24, 7j/7 (permanence des soins),

Réalisation de tests de sensibilité aux antibiotiques : antibiogramme en disque-diffusion et milieu liquide, concentration minimale inhibitrice (CMI)

Conseil thérapeutique de première ligne (antibiotiques, y compris antifongiques et antiparasitaires)

Participation à la Commission des Anti-Infectieux (CAI) pour la juste prescription des antibiotiques, antifongiques et antiparasitaires

Implication dans la prévention et la lutte contre les infections liées aux soins par détection, identification et typage moléculaire des bactéries multirésistantes (BMR) et hautement résistantes (BHRe) en collaboration avec le service Prévention et Contrôle des Infections

la prévention et la lutte contre les infections nosocomiales : identification et typage des bactéries multi-résistantes en collaboration avec le service de Prévention et Contrôle des Infections.

Rôle régional

Membre de la FeNOMIH (Fédération Hospitalo-Universitaire Normande de Microbiologie, Infectiologie et Hygiène Hospitalière)

Laboratoire associé au Centre de référence des Infections ostéo-articulaires complexes.

Cellule Régionale d’Epidémiologie génoMique (CREM) : centralisation au laboratoire des souches hautement résistantes, ou toute souche responsable d’épidémie de la région Normandie pour analyse moléculaire et compréhension des mécanismes de circulation des souches

Laboratoire référent pour le diagnostic anténatal de la toxoplasmose (agrément ministériel).

Institut Territorial de Biologie Santé
Les domaines d’expertise

Bactériologie

Diagnostic et antibiothérapie des infections ostéo-articulaires, des infections sur matériel intra-cardiaque et des endocardites infectieuses, des infections chez les sujets atteints de mucoviscidose, des infections par mycobactéries tuberculeuses et atypiques

Antibiorésistance (diagnostic phénotypique et moléculaire)

Analyse moléculaire

Contrôle microbiologique des produits de santé

Contrôle microbiologique de produits de santé (greffons, laits maternels, biothérapie).

Unité médico-judiciaire réquisitionnée pour l’analyse d’échantillons dans un contexte légal.

Centres & plateformes

	Centre de Référence Maladies Rares Infection Ostéo-Articulaire Complexe	Page du centre
	Plateforme Plateforme infectieuse	Page du centre
	Structure Département des Agents Infectieux	Page du centre

L’enseignement et la recherche

La Recherche

Du fait de son expertise et de ses recherches sur les pathogènes et les maladies infectieuses, le Groupe de Recherche sur l’Adaptation Microbienne (GRAM 2.0) a obtenu la labellisation INSERM avec création de l’Unité Mixte de Recherche UMR 1311 DYNAMICURE pour Dynamique Microbienne associée aux Infections Urinaires et Respiratoires.
L’UMR, créée le 1^er janvier 2022, se structure à nouveau en intégrant des bactériologistes fondamentaux de l’Université Caen Normandie (UCN), et des personnels du Labéo (pôle de recherche en santé animale), tout en centrant ses orientations scientifiques sur les infections urinaires et respiratoires.

Il regroupe les enseignants – chercheurs des laboratoires de:

Virologie (Pr A. VABRET, CHU Caen Normandie, Pr JC PLANTIER, CHU Rouen Normandie)

Bactériologie (Pr M. PESTEL-CARON, CHU Rouen Normandie, Pr O. JOIN LAMBERT, CHU Caen Normandie),

des services de :

Maladies Infectieuses et Tropicales (Pr R. VERDON, CHU Caen Normandie, Pr. F. CARON, CHU Rouen Normandie),

Pédiatrie (Pr J. BROUARD, CHU Caen Normandie)

Réanimation (Pr B. MISSET, CHU Rouen Normandie)

et la Direction pour la Recherche Clinique et l’Innovation (Pr JJ PARIENTI, CHU Caen Normandie).

Les principaux axes de recherche du laboratoire de Microbiologie sont :

l’étude de la virulence et des mécanismes de résistance aux antibiotiques de bactéries multirésistantes responsables d’épidémies et d’infections nosocomiales,

la physiopathologie moléculaire et la prise en charge des infections cutanées compliquées (incluant la maladie de Verneuil ou Hidrosadénite suppurée), avec pour modèle le pathogène opportuniste Staphylococcus lugdunensis

Pour répondre à ces questions, le service développe actuellement approche de séquençage à haut débit (NGS) en étroite collaboration avec les services de Virologie, d’Hygiène Hospitalière.

L’enseignement

Les praticiens du service participent à la formation théorique des étudiants de la Faculté de Médecine (UE Agents Infectieux) et de la Faculté de Pharmacie, des internes du DES de Biologie Médicale, des étudiants en Maïeutique, des infirmiers de bloc opératoire, des étudiants en BTS, en Sciences (licences, masters, doctorats, diplômes universitaires…).

Formation pratique au laboratoire

De par ses activités Hospitalo-Universitaires, le service est agréé pour la formation pratique des internes inscrits en DES de Biologie Médicale

Il est aussi impliqué dans la formation de personnels techniques, d’internes hors filière, de stagiaires en BTS, licences, masters, et de divers professionnels de santé dans le cadre de la formation continue.
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