Biologie

Bactériologie

Le laboratoire de Bactériologie analyse les prélèvements effectués chez les patients hospitalisés ou consultants au CHU Caen Normandie, à la recherche de bactéries pathogènes.

Équipe

Nos prises en charge

Centres & plateformes

L’enseignement et la recherche

Équipe
Nos prises en charge
Centres & plateformes
L’enseignement et la recherche

2 professeurs des universités · praticiens hospitaliers

1 maître de conférences des universités · praticien hospitalier

3 praticien(ne)s hospitalier(ère)s

1 assistant hospitalo-universitaire

1 cadre de santé

1 cadre supérieure de santé
Détail de l’équipe

Professeur des Universités · Praticien Hospitalier

Pr Simon Le Hello

Responsable ITBS

Praticienne Hospitalière

Dr Marguerite Fines-Guyon

Biologiste

Professeur des Universités · Praticien Hospitalier

Pr Olivier Join-Lambert

Bactériologie

Maître de Conférences des Universités · Praticien Hospitalier

Dr Christophe Isnard

Biologiste

Praticienne Hospitalière

Dr Claire Daurel

Praticien Hospitalier

Dr Damasie Malandain

Biologiste

Assistant hospitalier universitaire

Dr Francois Gravey

Biologiste

Cadre de santé

Manuela Leroux
Pr Simon Le Hello

Chef de service

Pr Simon Le Hello

Professeur des Universités · Praticien Hospitalier

Responsable ITBS

Profil

Florence Agourd

Cadre supérieure de santé

Florence Agourd

Cadre supérieure de santé

Profil
Nos prises en charge

Activités
Activités diagnostiques

Le secteur de Microbiologie regroupe les activités diagnostiques en Bactériologie et Parasitologie · Mycologie sur le site Côte de Nacre. Il est organisé en 6 sous-secteurs :

Bactériologie par culture bactérienne

Mycobactéries (laboratoire P3)

Parasitologie-Mycologie

Sérologie bactérienne, fongique et parasitaire

Biologie moléculaire

Identification, antibiotype, et typage moléculaire bactérien (activité pour l’hygiène hospitalière)

L’ensemble du personnel est engagé dans un système d’assurance qualité (Norme NF EN ISO 15189) afin de coordonner les moyens humains et les techniques (métrologie) pour répondre aux demandes de nos correspondants.

Missions hospitalières du laboratoire

Le diagnostic des infections bactériennes, fongiques et parasitaires 24h/24, 7j/7 (permanence des soins),

La réalisation d’antibiogrammes et d’antifongigrammes

Le conseil thérapeutique de première ligne pour les infections sévères (antibiotiques, antifongiques et antiparasitaires)

La juste prescription des antibiotiques dans le cadre de la Commission des Agents Infectieux (CAI)

la prévention et la lutte contre les infections nosocomiales : identification et typage des bactéries multi-résistantes en collaboration avec le service de Prévention et Contrôle des Infections.

Rôle régional du laboratoire

Membre de la FeNOMIH (Fédération Hospitalo-Universitaire Normande de Microbiologie, Infectiologie et Hygiène Hospitalière)

Laboratoire associé au Centre de référence des Infections ostéo-articulaires complexes.

Laboratoire référent pour le diagnostic anténatal de la toxoplasmose (agrément ministériel).

Activités de routine

Diagnostic microbiologique et conseil thérapeutique

Réalisation d’analyses bactériologiques, mycologiques et parasitologiques : examens directs, cultures, identifications par spectrométrie de masse de type MALDI-TOF, méthodes antigéniques, sérologiques et moléculaires (PCR spécifiques, « pan » bactériennes et fongiques)

Diagnostic classique et rapide (par biologie moléculaire) de la tuberculose ; diagnostic des infections à mycobactéries atypiques, antibiogrammes des mycobactéries

détermination de la sensibilité aux antibiotiques (antibiogramme), incluant la méthode de référence par micro-dilution en milieu liquide (Détermination des Concentration Minimales Inhibitrices) (Système VISION)

rôle d’alerte et de conseil thérapeutique en cas de diagnostic d’infections sévères (bactériémie, endocardite…).

Prévention du risque infectieux :

Identification des bactéries multi-résistantes (BMR) et Hautement Résistantes émergentes (BHRe).
Les domaines d’expertise

Bactériologie

diagnostic et antibiothérapie des infections ostéo-articulaires, des infections sur matériel intra-cardiaque et des endocardites infectieuses, des infections chez les sujets atteints de mucoviscidose, des infections par mycobactéries tuberculeuses et atypiques

antibiorésistance (diagnostic phénotypique et moléculaire)

typage moléculaire.

Parasitologie-Mycologie

diagnostic parasitologique et fongique, direct (morphologique et/ou moléculaire) et indirect (antigènes/anticorps)

résistance aux antifongiques

agrément pour le diagnostic prénatal de la toxoplasmose

activités de surveillance et de déclaration auprès des CNR (infections fongiques invasives, toxoplasmoses congénitales et acquises, paludismes d’importation, …).

Contrôle microbiologique des produits de santé

Contrôle microbiologique de produits de santé (greffons, laits maternels, biothérapie).

Unité médico-judiciaire réquisitionnée pour l’analyse d’échantillons dans un contexte légal.
Plateforme

Plateforme infectieuse
Page du centre

Structure

Département des Agents Infectieux
Page du centre
L’enseignement et la recherche
La Recherche

Le laboratoire fait partie du Groupe de Recherche sur l’Adaptation Microbienne (GRAM 2.0, EA 2656). Le GRAM est une équipe de recherche en infectiologie bi-site (Caen et Rouen) qui est sous la co-tutelle des Universités de Caen Normandie et de Rouen Normandie.

Il regroupe les enseignants – chercheurs des laboratoires de:

Virologie (Pr A. VABRET, CHU Caen Normandie, Pr JC PLANTIER, CHU Rouen Normandie)

Bactériologie (Pr M. PESTEL-CARON, CHU Rouen Normandie, Pr O. JOIN LAMBERT, CHU Caen Normandie),

des services de :

Maladies Infectieuses et Tropicales (Pr R. VERDON, CHU Caen Normandie, Pr. F. CARON, CHU Rouen Normandie),

Pédiatrie (Pr J. BROUARD, CHU Caen Normandie)

Réanimation (Pr B. MISSET, CHU Rouen Normandie)

et la Direction pour la Recherche Clinique et l’Innovation (Pr JJ PARIENTI, CHU Caen Normandie).

Les principaux axes de recherche du laboratoire de Microbiologie sont :

l’étude de la virulence et des mécanismes de résistance aux antibiotiques de bactéries multirésistantes responsables d’épidémies et d’infections nosocomiales,

la physiopathologie moléculaire et la prise en charge des infections cutanées compliquées (incluant la maladie de Verneuil ou Hidrosadénite suppurée), avec pour modèle le pathogène opportuniste Staphylococcus lugdunensis

Pour répondre à ces questions, le service développe actuellement approche de séquençage à haut débit (NGS) en étroite collaboration avec les services de Virologie, d’Hygiène Hospitalière.

L’enseignement

Les praticiens du service participent à la formation théorique des étudiants de la Faculté de Médecine (UE Agents Infectieux) et de la Faculté de Pharmacie, des internes du DES de Biologie Médicale, des étudiants en Maïeutique, des infirmiers de bloc opératoire, des étudiants en BTS, en Sciences (licences, masters, doctorats, diplômes universitaires…).

Formation pratique au laboratoire

De par ses activités Hospitalo-Universitaires, le service est agréé pour la formation pratique des internes inscrits en DES de Biologie Médicale

Il est aussi impliqué dans la formation de personnels techniques, d’internes hors filière, de stagiaires en BTS, licences, masters, et de divers professionnels de santé dans le cadre de la formation continue.