Skip to main content

Plateforme génomique

La plateforme regroupe des activités techniques de cyto-génétique et génétique moléculaire autour d’un même automate ou chaîne d’automates (extracteurs d’acide nucléiques, thermocycleurs dont temps réel, PCR digitale, séquenceurs, …) et/ou autour d’une même approche technologique (biologie moléculaire, génomique, cytogénétique, …) et dont leur rapprochement permet une mise en commun des moyens humains et techniques. La plateforme génomique regroupe ainsi les activités techniques des services de génétique, d’anatomie et cytologie pathologiques, d’hématologie biologique, de la structure fédérative d’oncogénétique cyto-moléculaire, de la plateforme génétique moléculaire des cancers, de la biochimie, de la pharmacologie, du HLA et de tous secteurs nécessitant ces approches.

L’objectif est de bénéficier de groupes de techniciens spécialisés et expérimentés sur leurs méthodes d’analyses, de rassembler/unifier les formations et d’optimiser les temps d’occupation sur les postes afin d’envisager de nouveaux développements et des innovations dans tous les domaines de la biologie médicale.

La Plateforme génomique est organisée en deux sous-secteurs : la génétique moléculaire et la cytogénétique.


  • Équipe

    Équipe qualité

  • Activités

    CIP (Comité interservices de Pilotage)
    • Coordinateurs de la plateforme : Guénaëlle Levallet, Nicolas Richard, François Gravey
    • Cadre de santé de la plateforme : Sandrine Renard, suppléant : Maxime Delahaye
    • Ingénieure de la plateforme : Nadia Coudray
    • Ingénieur bio-informaticien : Bryce Leterrier
    • Responsable laboratoire : Simon Le Hello
    • Cadre supérieure du pôle Biologie-Hygiène : Florence Agourd
    • Chefs de services (ou leur représentant) des disciplines utilisant la plateforme de génomique.
    • Biologistes utilisant la plateforme de génomique
    • Représentants du personnel technique : Brice Coulleray (Oncogénétique), Maryse Artu (Génétique constitutionnelle), Nathalie Millerioux (Cytogénétique)
    • Représentante du département biomédical : Catalina Vialle
    • Représentant de la direction système d’information : Irvin Madec
    • Responsable assurance qualité : Vincent Mathieu
    Missions principales du CIP
    • Valider les coordinateurs proposés par le responsable de Laboratoire, élus pour 5 ans renouvelable
    • Décider du mode de fonctionnement de la plateforme
    • Valider le choix du matériel et des logiciels relevant de la Commission d’Équipement du CHU Caen Normandie
    • Évaluer la faisabilité et valider le développement et la mise en production des nouvelles analyses
    Gros équipements
    • Extracteurs d’acide nucléique (Maxwell RSC 48, Promega ; Maxwell RSC , Promega ; Quickgene)
    • Robot de pipettage EP MOTION (5073 L, Eppendorf)
    • Parc de 16 thermocycleurs conventionnels, 3 temps réels (LightCycler 480, Roche ; 7500 Fast, Applied Biosystems) et 3 tiroirs Idylla (Biocartis)
    • Droplet Digitale PCR (QX200 Droplet Digital PCR System, Biorad)
    • Labchip (GX Touch HT, Perkinelmer)
    • 2 Préparateurs de Librairies (ZEPHYR NGS IQ, Perkinelmer ; STAR NGS, Hamilton)
    • Séquenceur Sanger (3500 Genetic Analyzer, Applied Biosystems)
    • 3 Séquenceurs Haut Débit (Nextseq550, Illumina ; S5 Prime + Ion Chef Instrument, Thermo Fisher et un Miseq, Illumina davantage consacré aux activités de recherche)
    • Scanners (CGH : SureScan G2600D, Agilent;  FISH : DM5500 B/DM6 B/DMR, Leica ; Pathscan, Excilone)
    • Trieur de cellules (AutoMACS Pro Separator, Miltenyi Biotec)
    • Appareil de num (XN-L-450, sysmex)