منصة علم الجينوم
تجمع هذه المنصة الأنشطة التقنية في علم الوراثة الخلوية وعلم الوراثة الجزيئية، والتي تتمحور جميعها حول نظام آلي واحد أو سلسلة من الأنظمة الآلية (مستخلصات الأحماض النووية، وأجهزة التدوير الحراري بما في ذلك أنظمة الوقت الحقيقي، البوليميراز المتسلسل ، وأجهزة التسلسل، وما إلى ذلك) وتقنية تفاعل الرقمي و/أو نهج تقني مشترك (علم الأحياء الجزيئي، وعلم الجينوم، وعلم الوراثة الخلوية، وما إلى ذلك). يتيح هذا التكامل تجميع الموارد البشرية والتقنية. وبذلك، تجمع منصة علم الجينوم الأنشطة التقنية لعلم الوراثة ، وعلم الأمراض ، وعلم الخلايا ، وعلم الدم ، واتحاد علم الوراثة الخلوية الجزيئية للأورام ، ومنصة علم الوراثة الجزيئية للسرطان ، والكيمياء الحيوية ، وعلم الأدوية ، ومستضدات الكريات البيضاء البشرية (HLA)، وجميع القطاعات الأخرى التي تتطلب هذه المناهج.
الهدف هو الاستفادة من مجموعات من الفنيين المتخصصين وذوي الخبرة في أساليبهم التحليلية، وتوحيد التدريب وتحسين الوقت الذي يقضيه الموظفون في الوظائف من أجل النظر في التطورات والابتكارات الجديدة في جميع مجالات علم الأحياء الطبي.
تنقسم منصة علم الجينوم إلى قطاعين فرعيين: علم الوراثة الجزيئية وعلم الوراثة الخلوية.
- الفريق والموقع
- 2
- علامة التبويب 3
- علامة التبويب 4
- علامة التبويب 5
- علامة التبويب 6
- تاب 7
- علامة التبويب 8
فريق
- العمل كمسؤول تنفيذي في مجال الصحةعلم الجينوم – BDR
- مهندس بالنيابةمدير تسلسل الأحماض النووية
- عالم المعلوماتية الحيوية
- مسؤول تنفيذي رفيع المستوى في مجال الرعاية الصحية
تضم المنصة مديرًا صحيًا واحدًا، و25 فنيًا، ومساعد مختبر واحد، ومهندسين اثنين.
تعمل منصة علم الجينوم بشكل رئيسي بالتزامن مع خدمات علم الوراثة،وعلم التشريح المرضي وعلم الخلايا،وعلم الدم البيولوجي، والهيكل الاتحادي لعلم الأورام الخلوي الجزيئي، ومنصة علم الوراثة الجزيئية للسرطانات، والكيمياء الحيوية، وعلم الأدوية و HLA .
أنشطة
لجنة التوجيه المشتركة بين الإدارات (CIP)- منسقو المنصة: جينيال ليفالي، نيكولا ريتشارد، فرانسوا جرافي
- مديرة صحة المنصة: أوليفيا فيريك، البديلة: مانويلا ليرو
- مهندسة المنصة: نادية كودراي
- مهندس المعلوماتية الحيوية: برايس ليترييه
- مدير المختبر: سيمون لي هيلو
- المديرة الأولى لقسم علم الأحياء والنظافة: ميلاني نونينماخر
- رؤساء الأقسام (أو ممثلهم) في التخصصات التي تستخدم منصة علم الجينوم.
- يستخدم علماء الأحياء منصة علم الجينوم
- ممثلو الطاقم الفني: بريس كوليري (علم الوراثة السرطانية)، ماريز أرتو (علم الوراثة الدستورية)، ناتالي ميليريو (علم الوراثة الخلوية)
- ممثلة قسم الطب الحيوي: كاتالينا فيالي
- ممثل قسم نظم المعلومات: إيرفين ماديك
- مديرة ضمان الجودة: بولين أوليفييه
المهام الرئيسية لـ CIP- الموافقة على المنسقين المقترحين من قبل مدير المختبر، والذين تم انتخابهم لفترة قابلة للتجديد مدتها 4 سنوات
- حدد كيفية عمل المنصة
- التحقق من صحة اختيار الأجهزة والبرامج وفقًا لما حددته لجنة المعدات في مستشفى جامعة كاين نورماندي
- تقييم جدوى تطوير وإنتاج التحليلات الجديدة والتحقق من صحتها
معدات كبيرة- مستخلصات الأحماض النووية (Maxwell RSC 48، Promega؛ Maxwell RSC، Promega؛ Quickgene)
- روبوت EP MOTION للتقطير (5073 L، إيبندورف)
- أسطول مكون من 16 جهاز تدوير حراري تقليدي، و3 أجهزة في الوقت الحقيقي (LightCycler 480، Roche؛ 7500 Fast، Applied Biosystems) و3 أدراج Idylla (Biocartis).
- تقنية تفاعل البوليميراز الرقمي بالقطرات (نظام QX200 لتفاعل البوليميراز ونظام QX600 لتفاعل البوليميراز ، من شركة Biorad) الرقمي بالقطرات الرقمي بالقطرات
- لاب تشيب (جي إكس تاتش إتش تي، بيركين إلمر)
- نظامان لإعداد المكتبات (ZEPHYR NGS IQ، بيركن إلمر؛ STAR NGS، هاميلتون)
- جهاز تسلسل سانجر (SeqStudio، Applied Biosystems)
- 3 أجهزة تسلسل عالية السرعة (Nextseq550، Illumina؛ S5 Prime + Ion Chef Instrument، Thermo Fisher وجهازان Miseq، Illumina، أحدهما DX، Illumina)
- الماسحات الضوئية (CGH: SureScan G2600D، Agilent؛ FISH: DM5500 B/DM6 B/DMR، Leica؛ Pathscan، Excilone)
- جهاز فرز الخلايا (AutoMACS Pro Separator، Miltenyi Biotec)
- جهاز ترقيم (XN-L-450، سيسميكس)
أخبار المنصة
فبراير 2025: تقوم فرقة العمل الجينومية (PTF) بشكل روتيني بتطبيق لوحة تسلسل جديدة عالية الإنتاجية!تم نشر لوحة جديدة (تسمى NGS_SP) تم تطويرها على وجه الخصوص من قبل الأطباء/علماء الأحياء في قسمي علم الوراثة (رئيس القسم: الدكتور نيكولاس غروشي) وعلم الدم البيولوجي (رئيس القسم: البروفيسور يوهان Repessé)، بمساعدة منهجية من مهندسة فريق العمل الجينومي، نادية كودراي، منذ بداية عام 2025.
- لوحة جديدة لأي غرض؟: التسلسل المتزامن لـ 55 جينًا!
- لوحة جديدة لأي أمراض؟: الأورام الصلبة وبعض الاضطرابات الدموية الخبيثة.
- معدل الجري: مرتين في الأسبوع.
يوليو 2024: تقوم فرقة العمل الجينومية (PTF) بشكل روتيني بتطبيق لوحة تسلسل جديدة عالية الإنتاجية!تم نشر لوحة جديدة (تسمى NGS_LP) تم تطويرها على وجه الخصوص من قبل الأطباء/علماء الأحياء في قسمي علم الوراثة (رئيس القسم: الدكتور نيكولاس غروشي) وعلم الدم البيولوجي (رئيس القسم: البروفيسور يوهان Repessé)، بمساعدة منهجية من مهندسة فريق العمل الجينومي، نادية كودراي، منذ صيف عام 2024.
- لوحة جديدة لأي غرض؟: التسلسل المتزامن لـ 177 جينًا!
- لوحة جديدة لأي أمراض؟: أمراض الدم الخبيثة ولكن ليس فقط ... يمكن تحليل أي عينة جديدة على هذه اللوحة (مثال: أمراض الأوعية الدموية).
- معدل التشغيل: مرة كل 15 يومًا.