منصة الجينوم

تجمع المنصة بين الأنشطة التقنية في مجال علم الوراثة الخلوية وعلم الوراثة الجزيئية حول نفس الإنسان الآلي أو سلسلة الآلات الآلية (مستخلصات الحمض النووي، والدوائر الحرارية بما في ذلك الوقت الحقيقي، وتفاعل البوليميراز المتسلسل ، وأجهزة التسلسل، وما إلى ذلك) و/أو حول نفس النهج التكنولوجي (البيولوجيا الجزيئية، وعلم الجينوم). ، وعلم الوراثة الخلوية، وما إلى ذلك) والتقارب بينهما يسمح بتجميع الموارد البشرية والتقنية. وبالتالي فإن منصة علم الجينوم تجمع بين الأنشطة الفنية لخدمات علم الوراثة والتشريح المرضي وعلم الخلايا وعلم الدم البيولوجي والهيكل الاتحادي الوراثة الخلوية الجزيئية ومنصة علم الوراثة الجزيئية للسرطان والكيمياء الحيوية وعلم الصيدلة و HLA وجميع القطاعات التي تتطلب هذه الأساليب .
الهدف هو الاستفادة من مجموعات الفنيين المتخصصين وذوي الخبرة في طرق التحليل الخاصة بهم ، للجمع / توحيد التدريب وتحسين أوقات العمل في الوظائف من أجل النظر في التطورات والابتكارات الجديدة في جميع مجالات البيولوجيا الطبية.
تم تنظيم منصة علم الجينوم في قسمين فرعيين: علم الوراثة الجزيئي وعلم الوراثة الخلوية .
-
مجهز
-
أستاذ جامعي · ممارس مستشفىعلم الأنسجة
-
العمل كمدير تنفيذي للصحةعلم الجينوم – BDR
-
مساعد مستشفى جامعيأحيائي
-
ممارس مستشفىعلم الوراثة الجزيئية
-
مهندس بالإنابةمسؤول عن تسلسل الحمض النووي
-
عالم المعلوماتية الحيوية
مجهز
-
مدير تأمين الجودة
-
ممارس مستشفى جامعيأمراض الدم البيولوجية
-
ممارس مستشفى
-
محاضر جامعي · ممارس مستشفىرئيس CNR
-
محاضر جامعي · ممارس مستشفىعلم الأنسجة
-
-
أنشطة
CIP (لجنة التوجيه المشتركة بين الإدارات)- منسقو المنصة: جينايل ليفاليت ، نيكولاس ريتشارد ، فرانسوا غرافي
- مديرة الصحة في المنصة: أوليفيا فيريك، البديلة: مانويلا ليرو
- مهندس المنصة: نادية كودراي
- مهندس المعلوماتية الحيوية: برايس ليترير
- مدير المختبر: Simon Le Hello
- المدير الأول لقسم الأحياء والنظافة: ميلاني نونينماخر
- رؤساء الأقسام (أو من يمثلهم) للتخصصات باستخدام منصة علم الجينوم.
- علماء الأحياء يستخدمون منصة علم الجينوم
- ممثلو الموظفين التقنيين: بريس كوليراي (علم الوراثة الوراثية) ، ماريز أرتو (علم الوراثة الدستورية) ، ناتالي ميليريوكس (علم الوراثة الخلوية)
- ممثل قسم الطب الحيوي: كاتالينا فيالي
- ممثل ادارة نظم المعلومات: ايرفين ماديك
- مدير ضمان الجودة: بولين أوليفييه
المهام الرئيسية لـ CIP- المصادقة على المنسقين المقترحين من قبل مدير المختبر المنتخبين لمدة 4 سنوات قابلة للتجديد
- قرر كيف ستعمل المنصة
- تحقق من صحة اختيار الأجهزة والبرامج بموجب لجنة CHU Caen Normandie للمعدات
- تقييم الجدوى والتحقق من تطوير وإنتاج تحليلات جديدة
معدات كبيرة- مستخلصات الحمض النووي (Maxwell RSC 48 ، Promega ؛ Maxwell RSC ، Promega ، Quickgene)
- روبوت سحب العينات EP MOTION (5073 L ، إيبندورف)
- متنزه يضم 16 جهاز تدوير حراري تقليدي ، 3 في الوقت الفعلي (LightCycler 480 ، Roche ، 7500 أنظمة حيوية سريعة ، تطبيقية) و 3 أدراج Idylla (Biocartis)
- Droplet Digital PCR ( نظام PCR PCR ، Biorad)
- Labchip (GX Touch HT ، Perkinelmer)
- 2 من معدي المكتبة (ZEPHYR NGS IQ ، Perkinelmer ؛ STAR NGS ، هاميلتون)
- جهاز تسلسل سانجر (SeqStudio، والنظم البيولوجية التطبيقية)
- 3 أجهزة تسلسل عالية الإنتاجية (Nextseq550، Illumina؛ S5 Prime + Ion Chef Instrument، Thermo Fisher واثنان Miseq، Illumina بما في ذلك جهاز DX، Illumina)
- الماسحات الضوئية (CGH: SureScan G2600D، Agilent؛ FISH: DM5500 B / DM6 B / DMR، Leica؛ Pathscan، Excilone)
- فارز الخلايا (فاصل AutoMACS Pro ، Miltenyi Biotec)
- جهاز العد (XN-L-450، sysmex)
-
أخبار من المنصة
يوليو 2024: تنفذ PTF Genomics بشكل روتيني لوحة تسلسل جديدة عالية الإنتاجية!تم تطوير لجنة جديدة (تسمى NGS_LP) بشكل خاص من قبل الأطباء/علماء الأحياء من قسم علم الوراثة (الرئيس: الدكتور نيكولاس غروشي) وأمراض الدم البيولوجية (الرئيس: البروفيسور يوهان Repessé)، بمساعدة منهجية من مهندسة الجينوم في PTF، نادية كودراي، تم نشره منذ صيف 2024.
- لوحة جديدة لماذا؟ : التسلسل المتزامن لـ 138 جينًا!
- لوحة جديدة لأي الأمراض؟ : الأورام الدموية الخبيثة ولكن ليس ذلك فحسب... يمكن تحليل أي عينة جديدة على هذه اللوحة (على سبيل المثال: أمراض الأوعية الدموية).
- تكرار التشغيل: مرة واحدة في الأسبوع